根据https://github.com/yongkangchen/atom-ctags/issues/200，要手动找到ctags.node的位置，kkraju4u提示用locate ctags.node，locate命令是由mlocate提供的。而安装好mlocate之后直接locate会报错没有db，根据stackexchange知道要用sudo ionice -c3 updatedb来更新db。然后就可以获得ctags.node的位置，直接修改~/.atom/packages/atom-ctags/node_modules/ctags/src/ctags.coffee的第一行，改一下就好了。